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64线硅光电池列阵在DNA序列自动分析仪上的应用

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  一、概述

  DNA,即脱氧核糖核酸,它是生命的基础物质,通过它编码蛋白质,编码结果取决于DNA中碱基排列情况,也就是DNA序列情况。对DNA序列的分析无论是在基础生物还是在医学领域都是非常重要的,例如,在医学上,通过对病气某些提取物细胞中DNA序列的分析,便可以找到发病的根本原因。

  现在,我国大部分生物研究所和医院化验科中,基本上都是采用传统方法研究DNA序列,即首先电泳DNA,随后进行放射性显影,获得DNA电泳图后进行人工读片。这种方法的缺点是耗时、准确性差,由于人工诊片取决于各人的经验与电泳图质量的好坏,因而得出结论往往不同.图1为放射性显影后所得的电泳图.具体的读图方法可以参见生化教材。

  为了克服传统方法的缺点,我们设计了一种DNA序列自动分析仪器,它取代了人工读片的工作.这种仪器于八十年代初已在美国出现。自动分析仪一般由扫描仪与图谱识斜程序包组成。美国LKB公司生产的扫描仪全称为“UltroscanLaserDensitometer,,其原理徉.我们汾什的基一知平由扫描仪,两者原理上可能有一些差别,但其目的都是一样的。至今,国内还没有有关研制这类仪器的报导.

  二、工作原理

  这里主要拟述扫拓仪的工作原理.其目的就是把DNA电泳图谱数字化.具体方法是:在图片下方放置光源,在其上方放置可以移动的传感器。使感器的输出与模数转换器相联,这样电泳图中明暗相间的条纹就可以变为大小不同的数字量,再通过一系列的数字信号处理与模式识别,便可自动排出DNA序列,图2为其示意图.

  采样与模数转换板使用的是模拟开关、放大器、用于控制模拟开关启闭的逻辑门、AD570.工作时,280:聆小单元执行采样程序,顺序打开各路模拟开关,使各路光强信号进行模数转换,随后通过PIO口将转换后的数字量暂存于RAM区。通过改变MCS一5]单片机输出的控制信号频率,可使步进电机以各种转速工作。主机中执行模式识别软件,为提高采样率,识别与采样同时进行,通过接口进行协调,这样可

  以丢掉识别过的大量数据,使内存容量足以满足工作要求。

  三、传感器的选择与技术指标

  该仪器中传感器的选择直接影响到能否正确排序。在此找们将传感器材料定为硅光电池,其它要求中首先是对尺寸的要求,要使每个单元足够小,能够保证不丢失图片上任何一个与识别有关的信息.为了减轻识别软件的工作量与执行时间,我们一次扫描只对准电泳图中某相邻的四弄,我们所设计的机构能使传感器横向移动,以对准位置。一般电泳图中片四弄加起来的宽度<38mm,为了不丢失信息,传感器上应设计上64个硅光电池单元.且每个单元尺寸为0.5x0.smm,单儿间距离为0.05mm.由这些单元组成的单排列阵可以满足要求.其次,由于AD570转换速率为25哪,采样率很高,同时,传感器在移动时光强时刻变化,因此要求传感器的延迟很小。也就是说,当光强由高变低或由低变高时,其输出能够在很短的时间内稳定在当前光强的对应输出值上,这样才能保证采样所得信号不失真,因此定传感器的开关速度<1卜5.由于采样与模数转换板工作时会产生反向电压,因此定其反向击穿电压>SV.扫描仪所用光源为一般普遍光源,所以传感器的光谱范围参照SL87卜1010。该列阵封于镀金印刷板上,为减小尺寸,引出脚分两边引出,且使用双排扦孔.

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标签: 传感器
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