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基于纳米孔测序技术的 PNA/λDNA测序精确度研究

作者: 罗帆 熊珊珊 来源:机械设计与制造工程 日期: 2025-02-10 人气:120
基于纳米孔测序技术的 PNA/λDNA测序精确度研究
通过字符串匹配算法模拟PNA探针与λDNA匹配过程。在考虑PNA探针的碱基数目以及芯片厚度的情况下,模拟了3merPNA探针和5merPNA探针与λDNA的匹配过程,以读取λDNA碱基序列信息。实验结果表明,基于单分子纳米孔的第三代测序技术读取λDNA碱基可以达到较高的精度,为下一步基因测序实验奠定了理论基础。

DNA测序电泳荧光信号的小波去噪分析

作者: 郑华 石岩 汪洁 王立强 陆祖康 来源:光学仪器 日期: 2023-11-30 人气:5
DNA测序电泳荧光信号的小波去噪分析
在DNA荧光测序中,噪声影响分析的准确度和检出限。相比其他滤波方法,小波分析具有良好的时频域分辨特性。在小波去噪处理中,正确选择合适的小波基函数和去噪阈值直接关系到信号去噪处理的质量。通过对毛细管电泳(CE)荧光信号的仿真分析,结果表明:选择sym7小波基函数、分解层数(1ev=5)与使用软阈值,可以有效去除CE荧光光谱信号的噪声,提高分析准确度。将其用于处理实际的DNA电泳荧光信号,效果良好。
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