大深度载人潜水器是海洋资源开发的关键工具，而液压系统是载人潜水器深海作业的重要动力源。在对“蛟龙”号载人潜水器深海作业中液压系统的故障分析基础上，提出了液压系统电气控制独立分离方案以及阀箱油路改进措施，解决了分系统控制故障叠加及阀箱内泄漏的重大问题。实践证明，该方案能够有效减少潜水器液压系统故障，增加载人潜水器深海作业的稳定性及可靠性。对备航维护、海底作业、日常检查等提出了注意事项，并对大深度载人潜水器液压系统的故障分析做了展望。