液流系统两条主液路输出压力的平稳性、准确性是流式细胞仪功能实现的基础。针对传统液路输出压力同步性和准确性低的问题，提出通过模糊自适应PID算法对控制环中参数进行自整定的主从控制结构。根据气动控制元件动态模型与模糊控制器原理，构建主从闭环反馈控制系统，并利用Simulink对系统进行了建模，得到了不同控制信号及控制参数下系统的响应曲线。对响应曲线的分析结果表明，在流式细胞仪液流系统工作压力范围内，模糊PID控制的双液路主从系统的输出压力超调量降低8％，响应调整时间缩短1／2，同步误差小于1％，与传统PID控制的单液路相比，提高了系统压力输出的精度和稳定性。