针对基于交流采样原理的智能仪器，提出一种新的测量不确定度评定模型。以信号功率测量为例，受硬件条件以及信号频率波动的影响，无法确保同步采样，利用已有测量算法将使测量结果出现误差。将该误差视为系统效应，通过近似处理，提出简单且实用的修正算法。将测量过程中的量化噪声、信号传输中的干扰当作具有已知分布特征的随机变量，利用统计方法，并依据测量不确定度传播定律，评定了经修正算法修正后的测量结果的不确定度。这种先修正系统效应、再评定随机因素造成不确定度的模型，更符合测量过程的实际情况。物理实验和仿真计算均验证了所得结论的有效性。