扫描隧道显微镜（简称STM）所采集到的隧道电流信号，不仅包含着表征样品的表面形貌和分子结构的有效信号，而且还隐含着整个扫描隧道显微系统的动态特性．针对STM采集的信号，运用短时傅立叶变换对其波形数据进行功率谱密度估计，对信号在频率域中的特征向量加以提取．结果表明：基于谱空间的特征向量，准确地分辨出了工频在信号中的干扰，也能有效地解释和分析STM系统的动态特性，进而认为存在一小阻尼系统对信号施以影响；此外，分析的结果可以为STM扫描过程的控制，诊断以及扫描图像的重建和解释提供有力的理论指导．