北京正负电子对撞机BEPCⅡ的二期改造工程为中国科学院重大项目改造工程，BESⅢ束流管冷却系统对BESⅢ束流管进行冷却，其中BESⅢ束流管冷却系统的自动监控系统负责BESⅢ束流管冷却系统的全面安全可靠运行。从工程设计的角度出发，介绍了自动监控系统的主要结构、工作原理、监控系统硬件选型及软件设计，并对系统的可靠性进行分析。运行结果表明，该监控系统满足BESⅢ束流管冷却系统的工艺要求，安全可靠。