分析了光电经纬仪工作方式切换过程中系统发生跃变、超调的原因，并采用了一种初值补偿的方法解决该问题。建立了系统切换过程的数学模型，并从理论上阐述了产生这些问题的原因。针对这些问题，设计了一种基于补偿控制器输出的初值补偿切换算法，并给出了加入初值补偿之后的系统数学模型和响应形式，以及该算法的具体实现。最后，通过仿真实验，验证了该方法能够将脱靶量跃变抑制在0．003。以下，有效地改进了系统的动态过程，并抑制了切换过程中产生的跃变。