新一代大射电望远镜（LT）粗调系统是通过6根索长的协调变化驱动馈源舱跟踪射电源的六自由度运动，其工作特点类似Stewart平台，因此被看作大柔性Stewart平台。针对该系统变结构、非线性、大滞后、强耦合等特点，提出一种卡尔曼滤波和基于优化神经网络结构的PID控制器（PID-NNC）相结合的控制算法来实现馈源轨迹跟踪控制。这种新方法通过构造卡尔曼滤波来抑制随机干扰对系统的影响，同时采用PID-NNC来实现馈源舱轨迹跟踪。理论分析和仿真实验表明，该控制算法不仅能满足对轨迹跟踪精度要求，而且具有较强的鲁棒性。